Le programme de recherche PERSIST

En Polynésie française, la perliculture repose exclusivement sur l’utilisation de naissains de Pinctada margaritiferaobtenus par collectage en milieu naturel. Depuis peu, certains lagons producteurs enregistrent une forte baisse du nombre de naissain collectés. Une étude récente du lagon perlicolede Ahe rapporte une forte hétérogénéité du sex-ratio des populations de P. margaritifera, avec des populations naturelles vieillissantes dominées par les femelles, et des populations cultivées jeunes et dominées par les mâles. De plus, il existe une différence de densité entre stock naturel et stock exploité (500 000 huîtres naturelles pour 14 millions d’huîtres exploitées) ce qui pourrait empêcher une reproduction optimale des populations du lagon (naturelles et cultivées) et résulter en une baisse significative du collectage dans ce lagon. Le projet PERSIST va servir à l’étude de la structure génétique des populations naturelles, cultivées et des naissains collectés dans le lagon durant un épisode de reproduction, afin de quantifier l’admixture entre populations naturelles et cultivées, estimer la contribution du stock naturel et du stock cultivé dans la production de larves, et dresser un bilan génétique sur la durabilité des pratiques perlicoles à Ahe. Aujourd’hui,  les ressources génétiques de P. margaritifera consistent en quelques marqueurs nucléaires anonymes et dix microsatellites. Ces marqueurs, bien que très utiles pour certaines problématiques, montrent leur limitation lors d’études génétiques à fine échelle populationnelle. Il est donc nécessaire d’obtenir de nouveaux marqueurs pour augmenter la résolution des analyses génétiques réalisées sur l’huître perlière. Pour cette étude, de nouvelles ressources génomiques seront développées pour P. margaritifera : le projet PERSIST permettra donc, au-delà de sa problématique scientifique, de développer un RAD-seq sur cette espèce, et bénéficiera d’un appui supplémentaire par l’assemblage actuel du génome de P. margaritifera par les chercheurs de l'unité RMPF.

Source de financement	Labex Corail, projet incitatif
Subvention accordée	15 000€
Durée du projet	1 an
Date de démarrage	01/01/2017
Coordinateur	Céline REISSER
Partenaires	CRIOBE