4 nouvelles publications résultant d'activités VIVALDI publiées en 2017
En 2017 et début 2018, des chercheurs italiens et français impliqués dans VIVALDI ont publié 4 articles mettant en valeur des résultats scientifiques obtenus grâce au projet.
Manuscrit: Whole-genome enrichment provides deep insights into Vibrio cholerae metagenome from an African river. (Vezzulli L, Grande C, Tassistro G, Brettar I, Höfle MG, Pereira RPA, Mushi D, Pallavicini A, Vassallo P, Pruzzo C)
Publié dans Microbial Ecology, 2017, doi: 10.1007/s00248-016-0902-x
Partenaire impliqué dans VIVALDI : UNIGE (IT)
Une nouvelle technologie d'enrichissement du génome entier de la bactérie Vibrio cholerae a été développée et appliquée à de l'eau de ricière contaminée afin d'obtenir 2000 fois plus d'ADN de pathogène au niveau du génome. Ce protocole pourrait être appliqué à d'autres microbes avec d'importantes applications en épidémiologie et en recherche de source microbienne.
Manuscrit: Comparative 16SrDNA gene-based microbiota profiles of the Pacific oyster (Crassostrea gigas) and the Mediterranean mussel (Mytilus galloprovincialis) from a shellfish farm (Ligurian Sea, Italy). (Vezzulli L, Stagnaro L, Grande C, Tassistro G, Canesi L, Pruzzo C)
Publié dans Microbial Ecology, 2018, doi: 10.1007/s00248-017-1051-6
Partenaire impliqué dans VIVALDI : UNIGE (IT)
La communauté bactérienne (microbiote) associée à l'huître creuse Crassostrea gigas et à la moule méditerranéenne Mytilus galloprovincialis a été évaluée et comparée avant et après dépuration commerciale en utilisant la technologie de dernière génération pour le séquençage d'ADN. L'étude montre l'inefficacité des pratiques de dépuration communément employées pour évacuer les microbes naturellement présents dans l'environnement aquatique (i.e. espèces de Vibrio) des tissus des bivalves.
The study highlighted the ineffectiveness of commonly employed depuration practice in removing microbial pathogens naturally occurring in the aquatic environment (e.g. Vibrio species) from bivalve tissues.
Manuscrit: Oyster RNA-seq Data Support the Development of Malacoherpesviridae Genomics. (Rosani U, Venier P)
Publié dans Front Microbiol, 2017 Aug, doi: 10.3389/fmicb.2017.01515
Partenaire impliqué dans VIVALDI : UNIPD (IT)
Les infections virales causées par l'Ostreid Herpesvirus type 1 (OsHV-1) sont un vrai défi pour le secteur conchylicole. La connaissance moléculaire des infections est essentielle pour permettre la mise en place de stratégies de prévention et de contrôle. Bien qu'appartement au même groupe que certains virus d'humains et vertébrés, les virus de mollusques sont liés d'assez loin aux autres membres de la famille des Herpesviridae et donc plus difficiles à comprendre. Cette publication décrit le comportement moléculaire du virus et identifie des signatures de gènes possiblement associés à différentes phases d'infection.
Manuscrit: Haemocytes from Crassostrea gigas and OsHV-1: A promising in vitro system to study host/virus interactions. (Benjamin Morga, Nicole Faury, Stéphane Guesdon, Bruno Chollet, Tristan Renault)
Publié dans Journal of Invertebrate Pathology (2017) DOI:10.1016/j.jip.2017.09.007
Partenaire impliqué dans VIVALDI : IFREMER (F)
The present study aimed at finding out if haemocytes (cell of the haemolymph of various invertebrates) can host the OsHV-1 virus in the Pacific oyster. To this end, haemocytes were collected from healthy Crassostrea gigas spat and exposed in vitro to a viral suspension. Results showed that the virus was detectable one hour after contact and the number of virus transcripts increased over time in association with an increase of viral DNA detection, which suggested that the virus was able to replicate rapidly inside haemocytes maintained in vitro. All the results suggested that the in vitro model using haemocytes can be valuable for providing new perspective on virus-oyster interactions.