L'objectif de ce premier axe est de trouver, décrire, mesurer et comprendre les interactions qui ont lieu dans l'environnement du coquillage, qui peuvent les rendre malades.
L'objectif de ce 3e axe est de développer des huîtres et des palourdes résistantes aux maladies, tout en maintenant la plus grande diversité génétique possible. L'impact potentiel de la sélection génétique sera également exploré.
L’objectif de ce 5e axe est de produire, grâce aux connaissances acquises dans les 4 autres axes, des recommandations générales sur la façon dont on pourrait mieux protéger les exploitations conchylicoles contre les maladies.
L'objectif de ce second axe est d'accroître les connaissances sur les fonctions physiologiques qui permettent aux animaux de résister aux maladies. La question de comment les pathogènes environnants interagissent avec les animaux dit également faire l'objet d'études.
L'objectif de ce quatrième axe est de mieux identifier l'état de santé des coquillages, en trouvant de nouveau symptômes qui pourront aider à identifier plus en amont les animaux malades.
L'objectif de ce 6e axe est d'assurer la meilleure dissémination possible des activités du projet et de ses résultats, au-delà de la communauté scientifique.